Les ateliers

Les 4 ateliers proposés se déroulent sur deux demi-journées. Pour les ateliers 1, 2 et 3, chaque demi-journée suit le même protocole. En revanche, le protocole de l'atelier 4 s’étend sur les deux demi-journées, mais chacune d’elles reste accessible de manière indépendante : il n’est donc pas nécessaire d’assister à la première pour participer à la seconde, et vice-versa.

Atelier 1: FLUO-MITO

Animatrice: Karine Salin (LEMAR) & Aline Amérand (ORPHY)

Objectif: Mesure simultanée des taux de consommation en oxygène et production d'ATP par la mitochondrie. Comparaison des fonctions mitochondriales dans 2 conditions qui sont connues pour affecter la quantité d’ATP produite par oxygène consommé.

Variable/Output: OXPHOS, LEAK, production d'ATP, ATP/O

Equipement utilisé: Oxygraphe à haute résolution équipés de modules fluorescent (marque Oroboros), intégration des données par le logiciel DatLab, et analyses les flux sur excel.

Niveau organisationel : Mitochondrie isolée

Modèle biologique : Huître (branchie)

Atelier 2: SEAHORSE

Animateurs : Mickael Théron (ORPHY) 

Objectif: Initiation aux fonctionnalités et à la manipulation du Seahorse avec des cellules de mammifères, discussion du transfert possible sur les cellules d'ectothermes, sur la gestion de la température et des cellules non adhérentes.

Variable/Output: Mesure de la consommation d'oxygène et de la glycolyse (en parrallele d'injection d'oligomycine, FCCP rotenone/antimycine), utilisation de la fonctionnalité de comptage de cellules et de normalisation.

Equipement utilisé: Seahorse

Niveau organisationel : Cellule (cardiomyoblastes)

Modèle biologique: Rat

Atelier 3: Microrespiromètres

Animateurs : Sylvain Pincebourde (IRBI)

Objectif: Mesurer la variabilité inter-individuelle de la consommation d'oxygène (MO2), discussion de l'effet de la taille, et d'autres paramètres.

Variable/Output: Consommation d'oxygène (MO2) consommée au cours du temps 

Equipement utilisé: Microrespiromètres Loligo (microplate system)

Niveau organisationel : Individu entier

Modèle biologique: Daphnie ou insectes à déterminer

Atelier 4: Respiro-Box

Animateurs : David McKenzie (MARBEC), Loïc Teulier (LEHNA), Christel Lefrançois (LIENSs)

Objectif: Mesurer le taux métabolique de routine et de repos chez le crabe vert, Cas concret de la mesure de la respiration résiduelle. 

Variable/Output: Consommation en oxygène de l'individu, métabolisme standard, consommation bactérienne

Equipement utilisé: Sonde et boitier Firesting, boites hermétiques

Niveau organisationel étudié: Individu entier

Modèle biologique: Crabe vert